在(zai)神(shen)經(jing)科學研(yan)究中,尤(you)其是在(zai)體(ti)實驗,通常利用(yong)腺相關病毒(AAV)工(gong)具載體(ti)研(yan)究基因(yin)在(zai)神(shen)經(jing)系(xi)統(tong)中的功能(neng)作(zuo)用(yong),原因(yin)在(zai)于(yu)相較于(yu)其他(ta)基因(yin)運載工(gong)具,AAV病毒具有免疫原性低(di)、安全(quan)性好并能(neng)實現基因(yin)的長效表達(da)等優點。
AAV載體的選擇
腺(xian)相(xiang)關病毒為單(dan)鏈(lian)DNA病毒(ssAAV), 在入核、脫衣殼后(hou),需要借助宿主DNA聚合酶或者分子間退火完成雙(shuang)鏈(lian)轉(zhuan)化,才能(neng)啟動基(ji)(ji)因(yin)轉(zhuan)錄過程(cheng),這(zhe)一(yi)(yi)過程(cheng)限制(zhi)了AAV載體介導(dao)的(de)基(ji)(ji)因(yin)轉(zhuan)導(dao),并直接影響病毒的(de)感(gan)染效率。自身互補雙(shuang)鏈(lian) DNA 的(de)腺(xian)相(xiang)關病毒(scAAV)能(neng)夠(gou)克服這(zhe)一(yi)(yi)限制(zhi),不需要經歷一(yi)(yi)個由單(dan)鏈(lian)變為雙(shuang)鏈(lian)的(de)過程(cheng),也就是說,雙(shuang)鏈(lian)AAV病毒進(jin)入細胞(bao)后(hou),可以(yi)直接表達(da)(da),并且表達(da)(da)時間更(geng)快(kuai),表達(da)(da)水平更(geng)高。因(yin)此,在神經研究(jiu)中,您(nin)也可以(yi)根據需要選擇scAAV載體,完成目的(de)基(ji)(ji)因(yin)更(geng)快(kuai)表達(da)(da),或者基(ji)(ji)因(yin)更(geng)強表達(da)(da)的(de)研究(jiu)。
ssAAV & scAAV
啟(qi)動子的選擇
根據啟動(dong)子(zi)(zi)的(de)(de)表達特(te)征,我們通常將啟動(dong)子(zi)(zi)分為組成型(xing)(xing)啟動(dong)子(zi)(zi)、誘導(dao)型(xing)(xing)啟動(dong)子(zi)(zi)以及器官(guan)/組織特(te)異性啟動(dong)子(zi)(zi),這些啟動(dong)子(zi)(zi)各具(ju)特(te)色。神經系統的(de)(de)組成及其復雜,腦部(bu)的(de)(de)精密研究(jiu)非(fei)常關鍵。要(yao)想實現(xian)某個(ge)腦區甚(shen)至(zhi)是某一(yi)(yi)類細胞特(te)異性感染,選擇一(yi)(yi)種特(te)異性相對(dui)更強的(de)(de)啟動(dong)子(zi)(zi)尤為重要(yao)。
①組(zu)成型啟動子(zi)
一般來自于(yu)管家基因(yin),可連續不斷地(di)啟(qi)(qi)動基因(yin)的表達。如(ru)巨細胞病毒啟(qi)(qi)動子(zi)CMV、CMV增強子(zi)融合(he)的雞?-肌動蛋白啟(qi)(qi)動子(zi)CAG或泛素C啟(qi)(qi)動子(zi)UBC等(deng)等(deng)。
②誘導型啟動子
只有在一定的外(wai)界誘導或刺激作(zuo)用下才能啟(qi)動(dong)基因的表達,如四(si)環素啟(qi)動(dong)子TRE。
③器(qi)官/組織特(te)異性啟(qi)動子
只有在(zai)特(te)定的(de)(de)(de)器官(guan)/組織(zhi)中才能啟(qi)動(dong)基因(yin)的(de)(de)(de)表達,下(xia)圖為(wei)大家(jia)列出的(de)(de)(de)是(shi)一些(xie)常見的(de)(de)(de)神(shen)經組織(zhi)特(te)異性啟(qi)動(dong)子:
轉(zhuan)錄后調控元件的添加
除了啟動子外,AAV載(zai)體(ti)上其他元(yuan)件的(de)(de)使(shi)用與優化也(ye)非(fei)常(chang)關鍵,尤其是(shi)轉錄后調控元(yuan)件的(de)(de)添加(jia),對于(yu)mRNA的(de)(de)剪接及核輸出、mRNA的(de)(de)穩定性及翻譯等具有重(zhong)要(yao)意義(yi),下面列舉兩個對于(yu)提高(gao)外源基因表達非(fei)常(chang)重(zhong)要(yao)的(de)(de)轉錄后調控元(yuan)件。
① 內含子(zi)
真(zhen)(zhen)核(he)mRNA內(nei)含子在真(zhen)(zhen)核(he)生物基(ji)因(yin)表達(da)調控中(zhong)起著重要(yao)的(de)(de)作用,是(shi)轉基(ji)因(yin)研究中(zhong)提高外源基(ji)因(yin)表達(da)的(de)(de)重要(yao)元(yuan)件之一(yi)。在多數情(qing)況下,真(zhen)(zhen)核(he)mRNA內(nei)含子的(de)(de)存(cun)在可(ke)以提高基(ji)因(yin)的(de)(de)表達(da)水(shui)平,因(yin)為其剪接過程(cheng)會影響(xiang)mRNA新陳代謝的(de)(de)多個(ge)階(jie)段,包括(kuo)轉錄、RNA編輯、pre-mRNA的(de)(de)加(jia)(jia)工、mRNA的(de)(de)出核(he)運輸、翻(fan)譯等。所以說(shuo),在載體容量允許的(de)(de)情(qing)況下可(ke)添(tian)加(jia)(jia)一(yi)個(ge)內(nei)含子,有(you)助于刺激基(ji)因(yin)的(de)(de)表達(da)。
② WPRE元件
土撥鼠肝炎病毒轉錄后調節序列WPRE是一段順式作用(yong)的(de)RNA元件(jian),放在(zai)多聚(ju)腺苷酸化信(xin)號之前可(ke)顯著增加mRNA的(de)表達水平和翻譯效率(lv),進(jin)而(er)增強基因的(de)表達,并且(qie)WPRE插入病毒載體中還可(ke)以大大提升病毒包裝的(de)滴度。然而(er)由(you)于WPRE序列較(jiao)長(chang)(600bp左右),所以還需要視(shi)具體的(de)載體容量(liang)選擇性插入。
AAV注射方式的選擇
目前(qian)AAV在神經(jing)系統研究(jiu)中的注射方(fang)法主要有(you)3種:腦定位注射、靜脈(mo)注射和(he)腦脊液注射(she),每(mei)種注射(she)(she)方(fang)式各有優缺(que)點,研(yan)究(jiu)(jiu)者可根據具體(ti)的研(yan)究(jiu)(jiu)對象(xiang)以(yi)及(ji)實驗方(fang)案,選擇適合的注射(she)(she)方(fang)式,推薦進行預(yu)實驗對實驗
效(xiao)果做初步測試(shi),以得到更優的(de)選(xuan)擇方案。
值得注意的(de)(de)(de)是,除了以(yi)(yi)上(shang)(shang)所述(shu)各(ge)項(xiang)因(yin)素(su)(su)(su)外,AAV病毒本(ben)(ben)身(shen)的(de)(de)(de)滴度和(he)純度,目(mu)的(de)(de)(de)基(ji)因(yin)本(ben)(ben)身(shen)的(de)(de)(de)自然屬性(如胞(bao)內蛋(dan)白/分泌蛋(dan)白/轉運蛋(dan)白)以(yi)(yi)及AAV感染后所使用的(de)(de)(de)檢測方(fang)法等因(yin)素(su)(su)(su)也會影響(xiang)到基(ji)因(yin)最終的(de)(de)(de)表達效果(guo)。因(yin)此(ci),在(zai)神經系統(tong)研究中,想要驅動更高效的(de)(de)(de)基(ji)因(yin)轉導,可以(yi)(yi)綜(zong)合考慮以(yi)(yi)上(shang)(shang)各(ge)項(xiang)因(yin)素(su)(su)(su),優化(hua)選擇。